電子顯微鏡可用于細胞形態(tài)學酶標記等研究電鏡根據(jù)性能的不同分為兩種類型，即透射式電鏡(transmission electron microscope，，IEM)和掃描式電鏡(scanning electron microscope，SEM)。透射式電鏡主要用于細胞內(nèi)部結(jié)構(gòu)的觀察，所觀察的材料必須固定、脫水后用環(huán)氧樹脂等包埋，以超薄切片機切成50。100rim的超薄片，并用硝酸鉛、醋酸鈾等染色后才能觀察。掃描電鏡采用的是二次電子成像原理，即首先由電子槍發(fā)射的電子束形成電子探針在標本上掃描，然后標本被電子轟擊產(chǎn)生的二次電子被收集、轉(zhuǎn)換后放大，在熒光屏上成像。掃描電鏡所觀察的標本只需干燥、鍍金(使標本導電)，不需切片，因此，其常用于細胞或組織材料的表面立體圖像的觀察分析。掃描電鏡的分辨力不如透射式電鏡，一般只有6—10rim，但景深長，觀察的圖形富有立體感。 近年來，電子顯微技術無論是電鏡本身還是樣品制備都有很大的提高。從電鏡本身講，首先是電子束加速電壓的提高，從普通的lOOkV提高到500kV甚至達到3000kV，這樣穿透力更強，能觀察較厚的標本且分辨力大大提高，加速電壓超過500kV的電鏡稱為超高壓電鏡(ultravohage electron microscope)。其次是在電鏡上增加輔助設施如連接電腦，這樣使生物樣品的分析更加快捷、方便、準確。在樣品制備方面也不斷更新，如負染色、冰凍切片、金屬投影、冷凍蝕刻、暗場技術、放射自顯影、酶標記等。從而使電鏡技術不僅用于細胞形態(tài)學的研究，也用于生理、生化功能的研究。
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